Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Jmjd8Q3TA59 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Jmjd8Q3TA59 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms