Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNL4

UPF0728 protein C10orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3KNL4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q3KNL4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3KNL4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3KNL4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3KNL4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3KNL4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3KNL4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3KNL4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3KNL4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3KNL4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3KNL4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Q3KNL4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3KNL4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3KNL4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3KNL4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3KNL4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3KNL4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3KNL4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3KNL4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3KNL4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3KNL4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3KNL4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3KNL4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3KNL4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3KNL4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3KNL4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3KNL4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3KNL4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3KNL4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3KNL4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3KNL4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3KNL4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q3KNL4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q3KNL4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q3KNL4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms