Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M3Q31093 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M3Q31093 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2-M3Q31093 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2-M3Q31093 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
H2-M3Q31093 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M3Q31093 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2-M3Q31093 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2-M3Q31093 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2-M3Q31093 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2-M3Q31093 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
H2-M3Q31093 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M3Q31093 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M3Q31093 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M3Q31093 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M3Q31093 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M3Q31093 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M3Q31093 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M3Q31093 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M3Q31093 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms