Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Trpm1Q2TV84 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trpm1Q2TV84 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trpm1Q2TV84 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trpm1Q2TV84 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trpm1Q2TV84 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Trpm1Q2TV84 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trpm1Q2TV84 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trpm1Q2TV84 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trpm1Q2TV84 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trpm1Q2TV84 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trpm1Q2TV84 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Trpm1Q2TV84 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Trpm1Q2TV84 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Trpm1Q2TV84 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Trpm1Q2TV84 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Trpm1Q2TV84 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Trpm1Q2TV84 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Trpm1Q2TV84 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Trpm1Q2TV84 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Trpm1Q2TV84 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Trpm1Q2TV84 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Trpm1Q2TV84 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Trpm1Q2TV84 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trpm1Q2TV84 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trpm1Q2TV84 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trpm1Q2TV84 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Trpm1Q2TV84 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trpm1Q2TV84 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trpm1Q2TV84 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trpm1Q2TV84 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Trpm1Q2TV84 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trpm1Q2TV84 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trpm1Q2TV84 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trpm1Q2TV84 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trpm1Q2TV84 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trpm1Q2TV84 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trpm1Q2TV84 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Trpm1Q2TV84 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trpm1Q2TV84 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trpm1Q2TV84 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trpm1Q2TV84 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trpm1Q2TV84 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trpm1Q2TV84 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trpm1Q2TV84 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trpm1Q2TV84 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trpm1Q2TV84 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trpm1Q2TV84 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trpm1Q2TV84 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trpm1Q2TV84 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trpm1Q2TV84 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trpm1Q2TV84 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trpm1Q2TV84 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trpm1Q2TV84 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trpm1Q2TV84 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Trpm1Q2TV84 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Trpm1Q2TV84 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trpm1Q2TV84 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trpm1Q2TV84 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trpm1Q2TV84 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trpm1Q2TV84 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trpm1Q2TV84 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trpm1Q2TV84 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trpm1Q2TV84 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Trpm1Q2TV84 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trpm1Q2TV84 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trpm1Q2TV84 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trpm1Q2TV84 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Trpm1Q2TV84 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Trpm1Q2TV84 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trpm1Q2TV84 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trpm1Q2TV84 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trpm1Q2TV84 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trpm1Q2TV84 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trpm1Q2TV84 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trpm1Q2TV84 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trpm1Q2TV84 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trpm1Q2TV84 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trpm1Q2TV84 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Trpm1Q2TV84 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trpm1Q2TV84 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Trpm1Q2TV84 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trpm1Q2TV84 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Trpm1Q2TV84 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Trpm1Q2TV84 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trpm1Q2TV84 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trpm1Q2TV84 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trpm1Q2TV84 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trpm1Q2TV84 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trpm1Q2TV84 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trpm1Q2TV84 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trpm1Q2TV84 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trpm1Q2TV84 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trpm1Q2TV84 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trpm1Q2TV84 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trpm1Q2TV84 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trpm1Q2TV84 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trpm1Q2TV84 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trpm1Q2TV84 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trpm1Q2TV84 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms