Protein–RNA interactions for Protein: Q2QI47

Ush2A, Usherin, mousemouse

Predictions only

Length 5,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush2AQ2QI47 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ush2AQ2QI47 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ush2AQ2QI47 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ush2AQ2QI47 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ush2AQ2QI47 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ush2AQ2QI47 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ush2AQ2QI47 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ush2AQ2QI47 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ush2AQ2QI47 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ush2AQ2QI47 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms