Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpne9Q1RLL3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpne9Q1RLL3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms