Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Traf3ip1Q149C2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Traf3ip1Q149C2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Traf3ip1Q149C2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Traf3ip1Q149C2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Traf3ip1Q149C2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Traf3ip1Q149C2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Traf3ip1Q149C2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Traf3ip1Q149C2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Traf3ip1Q149C2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Traf3ip1Q149C2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Traf3ip1Q149C2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Traf3ip1Q149C2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Traf3ip1Q149C2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Traf3ip1Q149C2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Traf3ip1Q149C2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Traf3ip1Q149C2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Traf3ip1Q149C2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Traf3ip1Q149C2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Traf3ip1Q149C2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Traf3ip1Q149C2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms