Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGM9

Rtel1, Regulator of telomere elongation helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtel1Q0VGM9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rtel1Q0VGM9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rtel1Q0VGM9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rtel1Q0VGM9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rtel1Q0VGM9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rtel1Q0VGM9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rtel1Q0VGM9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rtel1Q0VGM9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rtel1Q0VGM9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rtel1Q0VGM9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rtel1Q0VGM9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rtel1Q0VGM9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rtel1Q0VGM9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rtel1Q0VGM9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rtel1Q0VGM9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rtel1Q0VGM9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rtel1Q0VGM9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rtel1Q0VGM9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rtel1Q0VGM9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rtel1Q0VGM9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rtel1Q0VGM9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rtel1Q0VGM9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rtel1Q0VGM9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rtel1Q0VGM9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rtel1Q0VGM9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rtel1Q0VGM9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rtel1Q0VGM9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rtel1Q0VGM9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rtel1Q0VGM9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rtel1Q0VGM9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rtel1Q0VGM9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rtel1Q0VGM9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rtel1Q0VGM9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rtel1Q0VGM9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rtel1Q0VGM9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rtel1Q0VGM9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rtel1Q0VGM9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rtel1Q0VGM9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rtel1Q0VGM9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rtel1Q0VGM9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rtel1Q0VGM9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rtel1Q0VGM9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rtel1Q0VGM9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rtel1Q0VGM9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rtel1Q0VGM9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rtel1Q0VGM9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rtel1Q0VGM9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rtel1Q0VGM9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rtel1Q0VGM9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rtel1Q0VGM9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rtel1Q0VGM9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rtel1Q0VGM9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rtel1Q0VGM9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rtel1Q0VGM9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rtel1Q0VGM9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rtel1Q0VGM9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rtel1Q0VGM9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Rtel1Q0VGM9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rtel1Q0VGM9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rtel1Q0VGM9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rtel1Q0VGM9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rtel1Q0VGM9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rtel1Q0VGM9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rtel1Q0VGM9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rtel1Q0VGM9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Rtel1Q0VGM9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rtel1Q0VGM9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rtel1Q0VGM9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rtel1Q0VGM9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rtel1Q0VGM9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rtel1Q0VGM9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rtel1Q0VGM9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rtel1Q0VGM9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rtel1Q0VGM9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rtel1Q0VGM9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rtel1Q0VGM9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rtel1Q0VGM9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rtel1Q0VGM9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rtel1Q0VGM9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rtel1Q0VGM9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rtel1Q0VGM9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rtel1Q0VGM9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rtel1Q0VGM9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rtel1Q0VGM9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rtel1Q0VGM9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rtel1Q0VGM9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rtel1Q0VGM9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rtel1Q0VGM9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rtel1Q0VGM9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rtel1Q0VGM9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rtel1Q0VGM9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rtel1Q0VGM9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rtel1Q0VGM9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rtel1Q0VGM9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rtel1Q0VGM9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rtel1Q0VGM9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rtel1Q0VGM9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rtel1Q0VGM9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rtel1Q0VGM9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rtel1Q0VGM9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms