Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
1700061G19RikQ08EE8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700061G19RikQ08EE8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms