Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rbp2Q08652 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.3 ms