Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cnn2Q08093 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cnn2Q08093 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms