Protein–RNA interactions for Protein: Q05A62

Dnal1, Dynein light chain 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal1Q05A62 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms