Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Thbs3Q05895 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Thbs3Q05895 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Thbs3Q05895 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms