Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crisp3Q03402 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms