Protein–RNA interactions for Protein: Q01730

Rsu1, Ras suppressor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsu1Q01730 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsu1Q01730 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsu1Q01730 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsu1Q01730 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsu1Q01730 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsu1Q01730 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsu1Q01730 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsu1Q01730 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsu1Q01730 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsu1Q01730 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsu1Q01730 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsu1Q01730 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsu1Q01730 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsu1Q01730 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsu1Q01730 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rsu1Q01730 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsu1Q01730 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsu1Q01730 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsu1Q01730 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsu1Q01730 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsu1Q01730 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsu1Q01730 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsu1Q01730 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsu1Q01730 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsu1Q01730 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsu1Q01730 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsu1Q01730 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsu1Q01730 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsu1Q01730 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsu1Q01730 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsu1Q01730 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsu1Q01730 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsu1Q01730 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsu1Q01730 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsu1Q01730 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsu1Q01730 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsu1Q01730 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsu1Q01730 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsu1Q01730 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsu1Q01730 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsu1Q01730 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsu1Q01730 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsu1Q01730 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsu1Q01730 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsu1Q01730 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsu1Q01730 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsu1Q01730 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsu1Q01730 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsu1Q01730 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsu1Q01730 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rsu1Q01730 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsu1Q01730 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsu1Q01730 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsu1Q01730 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsu1Q01730 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsu1Q01730 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsu1Q01730 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsu1Q01730 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsu1Q01730 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsu1Q01730 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsu1Q01730 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsu1Q01730 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsu1Q01730 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsu1Q01730 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsu1Q01730 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsu1Q01730 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsu1Q01730 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsu1Q01730 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsu1Q01730 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsu1Q01730 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsu1Q01730 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsu1Q01730 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsu1Q01730 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsu1Q01730 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsu1Q01730 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsu1Q01730 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsu1Q01730 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsu1Q01730 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsu1Q01730 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsu1Q01730 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsu1Q01730 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsu1Q01730 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsu1Q01730 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsu1Q01730 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsu1Q01730 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsu1Q01730 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsu1Q01730 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsu1Q01730 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsu1Q01730 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsu1Q01730 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsu1Q01730 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsu1Q01730 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsu1Q01730 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsu1Q01730 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsu1Q01730 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsu1Q01730 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsu1Q01730 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsu1Q01730 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsu1Q01730 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsu1Q01730 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms