Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sec23aQ01405 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sec23aQ01405 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec23aQ01405 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec23aQ01405 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec23aQ01405 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec23aQ01405 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec23aQ01405 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec23aQ01405 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec23aQ01405 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec23aQ01405 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec23aQ01405 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sec23aQ01405 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sec23aQ01405 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sec23aQ01405 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sec23aQ01405 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sec23aQ01405 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Sec23aQ01405 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Sec23aQ01405 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sec23aQ01405 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sec23aQ01405 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sec23aQ01405 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sec23aQ01405 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sec23aQ01405 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sec23aQ01405 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sec23aQ01405 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sec23aQ01405 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sec23aQ01405 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sec23aQ01405 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sec23aQ01405 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms