Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gja5Q01231 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gja5Q01231 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gja5Q01231 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gja5Q01231 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gja5Q01231 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gja5Q01231 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gja5Q01231 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gja5Q01231 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gja5Q01231 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gja5Q01231 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gja5Q01231 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gja5Q01231 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gja5Q01231 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gja5Q01231 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms