Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Col1a2Q01149 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col1a2Q01149 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col1a2Q01149 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col1a2Q01149 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col1a2Q01149 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col1a2Q01149 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col1a2Q01149 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col1a2Q01149 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col1a2Q01149 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col1a2Q01149 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col1a2Q01149 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col1a2Q01149 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col1a2Q01149 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col1a2Q01149 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col1a2Q01149 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col1a2Q01149 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col1a2Q01149 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col1a2Q01149 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col1a2Q01149 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col1a2Q01149 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col1a2Q01149 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Col1a2Q01149 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col1a2Q01149 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col1a2Q01149 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col1a2Q01149 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col1a2Q01149 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col1a2Q01149 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col1a2Q01149 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Col1a2Q01149 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col1a2Q01149 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col1a2Q01149 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col1a2Q01149 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col1a2Q01149 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col1a2Q01149 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col1a2Q01149 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col1a2Q01149 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col1a2Q01149 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col1a2Q01149 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col1a2Q01149 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col1a2Q01149 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col1a2Q01149 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col1a2Q01149 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col1a2Q01149 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col1a2Q01149 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col1a2Q01149 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col1a2Q01149 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col1a2Q01149 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col1a2Q01149 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col1a2Q01149 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Col1a2Q01149 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col1a2Q01149 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col1a2Q01149 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms