Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VegfaQ00731 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VegfaQ00731 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VegfaQ00731 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms