Protein–RNA interactions for Protein: Q00560

Il6st, Interleukin-6 receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il6stQ00560 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Il6stQ00560 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Il6stQ00560 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Il6stQ00560 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Il6stQ00560 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Il6stQ00560 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Il6stQ00560 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Il6stQ00560 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Il6stQ00560 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Il6stQ00560 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Il6stQ00560 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Il6stQ00560 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Il6stQ00560 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Il6stQ00560 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Il6stQ00560 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Il6stQ00560 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Il6stQ00560 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Il6stQ00560 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Il6stQ00560 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Il6stQ00560 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Il6stQ00560 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Il6stQ00560 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Il6stQ00560 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Il6stQ00560 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Il6stQ00560 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Il6stQ00560 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Il6stQ00560 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Il6stQ00560 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Il6stQ00560 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Il6stQ00560 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Il6stQ00560 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Il6stQ00560 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Il6stQ00560 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Il6stQ00560 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Il6stQ00560 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Il6stQ00560 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Il6stQ00560 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Il6stQ00560 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Il6stQ00560 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Il6stQ00560 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Il6stQ00560 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Il6stQ00560 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Il6stQ00560 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Il6stQ00560 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Il6stQ00560 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Il6stQ00560 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Il6stQ00560 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Il6stQ00560 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Il6stQ00560 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms