Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cds1P98191 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cds1P98191 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cds1P98191 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cds1P98191 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cds1P98191 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cds1P98191 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cds1P98191 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cds1P98191 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cds1P98191 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cds1P98191 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cds1P98191 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cds1P98191 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms