Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lama4P97927 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lama4P97927 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lama4P97927 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lama4P97927 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lama4P97927 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lama4P97927 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lama4P97927 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lama4P97927 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Lama4P97927 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lama4P97927 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lama4P97927 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lama4P97927 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lama4P97927 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lama4P97927 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lama4P97927 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lama4P97927 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lama4P97927 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lama4P97927 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lama4P97927 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lama4P97927 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lama4P97927 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lama4P97927 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Lama4P97927 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lama4P97927 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lama4P97927 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Lama4P97927 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Lama4P97927 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lama4P97927 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lama4P97927 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lama4P97927 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lama4P97927 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lama4P97927 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lama4P97927 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Lama4P97927 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lama4P97927 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lama4P97927 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lama4P97927 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lama4P97927 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lama4P97927 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lama4P97927 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lama4P97927 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lama4P97927 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lama4P97927 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lama4P97927 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lama4P97927 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lama4P97927 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lama4P97927 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lama4P97927 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lama4P97927 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lama4P97927 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lama4P97927 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lama4P97927 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lama4P97927 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lama4P97927 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lama4P97927 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lama4P97927 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lama4P97927 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Lama4P97927 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lama4P97927 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lama4P97927 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lama4P97927 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lama4P97927 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lama4P97927 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lama4P97927 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lama4P97927 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lama4P97927 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lama4P97927 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lama4P97927 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Lama4P97927 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lama4P97927 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lama4P97927 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lama4P97927 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lama4P97927 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lama4P97927 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lama4P97927 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lama4P97927 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lama4P97927 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Lama4P97927 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lama4P97927 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lama4P97927 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lama4P97927 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lama4P97927 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lama4P97927 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lama4P97927 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lama4P97927 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lama4P97927 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lama4P97927 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lama4P97927 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lama4P97927 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Lama4P97927 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lama4P97927 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lama4P97927 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lama4P97927 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lama4P97927 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lama4P97927 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lama4P97927 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lama4P97927 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lama4P97927 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lama4P97927 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms