Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarcc1P97496 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarcc1P97496 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarcc1P97496 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarcc1P97496 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarcc1P97496 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarcc1P97496 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarcc1P97496 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarcc1P97496 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarcc1P97496 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarcc1P97496 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarcc1P97496 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarcc1P97496 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarcc1P97496 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarcc1P97496 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarcc1P97496 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarcc1P97496 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarcc1P97496 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarcc1P97496 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarcc1P97496 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarcc1P97496 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarcc1P97496 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarcc1P97496 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Smarcc1P97496 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarcc1P97496 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarcc1P97496 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarcc1P97496 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarcc1P97496 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarcc1P97496 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarcc1P97496 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms