Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nbr1P97432 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nbr1P97432 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nbr1P97432 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nbr1P97432 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nbr1P97432 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nbr1P97432 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nbr1P97432 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nbr1P97432 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nbr1P97432 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nbr1P97432 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nbr1P97432 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nbr1P97432 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Nbr1P97432 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nbr1P97432 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nbr1P97432 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nbr1P97432 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nbr1P97432 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nbr1P97432 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nbr1P97432 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nbr1P97432 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nbr1P97432 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nbr1P97432 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nbr1P97432 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nbr1P97432 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nbr1P97432 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nbr1P97432 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nbr1P97432 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nbr1P97432 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nbr1P97432 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nbr1P97432 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nbr1P97432 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nbr1P97432 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms