Protein–RNA interactions for Protein: P86792

Ccl21b, C-C motif chemokine 21b, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl21bP86792 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl21bP86792 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms