Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gabpb2P81069 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gabpb2P81069 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gabpb2P81069 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gabpb2P81069 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gabpb2P81069 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms