Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr1bP70700 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms