Protein–RNA interactions for Protein: P70689

Gjb6, Gap junction beta-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb6P70689 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb6P70689 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gjb6P70689 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms