Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rad50P70388 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rad50P70388 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rad50P70388 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rad50P70388 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rad50P70388 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rad50P70388 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rad50P70388 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rad50P70388 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rad50P70388 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rad50P70388 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rad50P70388 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rad50P70388 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rad50P70388 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rad50P70388 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rad50P70388 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rad50P70388 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rad50P70388 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rad50P70388 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rad50P70388 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rad50P70388 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rad50P70388 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rad50P70388 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rad50P70388 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rad50P70388 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rad50P70388 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rad50P70388 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rad50P70388 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rad50P70388 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rad50P70388 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rad50P70388 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rad50P70388 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rad50P70388 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rad50P70388 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rad50P70388 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rad50P70388 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rad50P70388 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rad50P70388 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rad50P70388 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rad50P70388 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rad50P70388 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rad50P70388 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rad50P70388 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rad50P70388 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rad50P70388 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rad50P70388 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rad50P70388 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rad50P70388 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rad50P70388 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rad50P70388 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rad50P70388 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rad50P70388 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rad50P70388 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rad50P70388 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rad50P70388 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rad50P70388 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rad50P70388 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rad50P70388 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rad50P70388 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rad50P70388 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rad50P70388 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rad50P70388 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rad50P70388 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rad50P70388 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rad50P70388 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rad50P70388 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rad50P70388 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rad50P70388 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rad50P70388 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rad50P70388 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rad50P70388 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rad50P70388 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rad50P70388 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rad50P70388 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rad50P70388 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rad50P70388 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rad50P70388 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rad50P70388 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rad50P70388 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rad50P70388 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rad50P70388 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rad50P70388 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rad50P70388 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rad50P70388 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rad50P70388 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rad50P70388 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rad50P70388 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rad50P70388 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rad50P70388 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rad50P70388 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rad50P70388 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rad50P70388 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rad50P70388 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rad50P70388 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rad50P70388 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Rad50P70388 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rad50P70388 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rad50P70388 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rad50P70388 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms