Protein–RNA interactions for Protein: P70271

Pdlim4, PDZ and LIM domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim4P70271 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms