Protein–RNA interactions for Protein: P63268

Actg2, Actin, gamma-enteric smooth muscle, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actg2P63268 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actg2P63268 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actg2P63268 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Actg2P63268 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actg2P63268 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actg2P63268 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actg2P63268 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actg2P63268 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actg2P63268 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actg2P63268 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actg2P63268 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actg2P63268 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actg2P63268 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actg2P63268 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Actg2P63268 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Actg2P63268 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Actg2P63268 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Actg2P63268 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Actg2P63268 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Actg2P63268 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Actg2P63268 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Actg2P63268 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Actg2P63268 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Actg2P63268 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Actg2P63268 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Actg2P63268 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Actg2P63268 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Actg2P63268 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actg2P63268 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actg2P63268 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actg2P63268 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actg2P63268 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actg2P63268 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actg2P63268 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Actg2P63268 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actg2P63268 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Actg2P63268 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actg2P63268 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actg2P63268 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actg2P63268 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actg2P63268 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actg2P63268 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Actg2P63268 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actg2P63268 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actg2P63268 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actg2P63268 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actg2P63268 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actg2P63268 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actg2P63268 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actg2P63268 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actg2P63268 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actg2P63268 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actg2P63268 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Actg2P63268 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Actg2P63268 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms