Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Acta2P62737 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Acta2P62737 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Acta2P62737 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Acta2P62737 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Acta2P62737 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Acta2P62737 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Acta2P62737 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Acta2P62737 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Acta2P62737 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Acta2P62737 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Acta2P62737 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Acta2P62737 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Acta2P62737 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Acta2P62737 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Acta2P62737 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Acta2P62737 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Acta2P62737 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Acta2P62737 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Acta2P62737 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Acta2P62737 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Acta2P62737 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Acta2P62737 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Acta2P62737 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Acta2P62737 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Acta2P62737 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Acta2P62737 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Acta2P62737 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Acta2P62737 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Acta2P62737 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Acta2P62737 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Acta2P62737 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Acta2P62737 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Acta2P62737 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Acta2P62737 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Acta2P62737 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Acta2P62737 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Acta2P62737 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Acta2P62737 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Acta2P62737 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Acta2P62737 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Acta2P62737 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Acta2P62737 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Acta2P62737 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Acta2P62737 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Acta2P62737 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Acta2P62737 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Acta2P62737 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Acta2P62737 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Acta2P62737 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Acta2P62737 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Acta2P62737 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Acta2P62737 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Acta2P62737 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Acta2P62737 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Acta2P62737 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Acta2P62737 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Acta2P62737 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Acta2P62737 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Acta2P62737 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Acta2P62737 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Acta2P62737 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Acta2P62737 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Acta2P62737 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Acta2P62737 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Acta2P62737 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Acta2P62737 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Acta2P62737 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Acta2P62737 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Acta2P62737 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Acta2P62737 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Acta2P62737 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Acta2P62737 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acta2P62737 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acta2P62737 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acta2P62737 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acta2P62737 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acta2P62737 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acta2P62737 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Acta2P62737 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acta2P62737 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Acta2P62737 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acta2P62737 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acta2P62737 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acta2P62737 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acta2P62737 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acta2P62737 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acta2P62737 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acta2P62737 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acta2P62737 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acta2P62737 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acta2P62737 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acta2P62737 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acta2P62737 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acta2P62737 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acta2P62737 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acta2P62737 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acta2P62737 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acta2P62737 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Acta2P62737 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms