Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRPFP62306 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms