Protein–RNA interactions for Protein: P62301

Rps13, 40S ribosomal protein S13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps13P62301 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps13P62301 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps13P62301 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps13P62301 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps13P62301 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps13P62301 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps13P62301 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps13P62301 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps13P62301 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps13P62301 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps13P62301 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps13P62301 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps13P62301 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps13P62301 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps13P62301 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps13P62301 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms