Protein–RNA interactions for Protein: P62080

Tspan5, Tetraspanin-5, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan5P62080 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tspan5P62080 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan5P62080 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms