Protein–RNA interactions for Protein: P62046

Lrch1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch1P62046 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrch1P62046 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lrch1P62046 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrch1P62046 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms