Protein–RNA interactions for Protein: P59913

Pcmtd1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmtd1P59913 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcmtd1P59913 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcmtd1P59913 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms