Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tpm2P58774 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tpm2P58774 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms