Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Paxbp1P58501 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Paxbp1P58501 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms