Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pdcd5P56812 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdcd5P56812 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms