Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cux1P53564 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cux1P53564 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cux1P53564 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cux1P53564 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Cux1P53564 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cux1P53564 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cux1P53564 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cux1P53564 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cux1P53564 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cux1P53564 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cux1P53564 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cux1P53564 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cux1P53564 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cux1P53564 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cux1P53564 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cux1P53564 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cux1P53564 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cux1P53564 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cux1P53564 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cux1P53564 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cux1P53564 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cux1P53564 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cux1P53564 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cux1P53564 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cux1P53564 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cux1P53564 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cux1P53564 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cux1P53564 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cux1P53564 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cux1P53564 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cux1P53564 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cux1P53564 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cux1P53564 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cux1P53564 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Cux1P53564 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cux1P53564 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cux1P53564 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cux1P53564 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cux1P53564 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cux1P53564 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cux1P53564 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cux1P53564 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Cux1P53564 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cux1P53564 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cux1P53564 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cux1P53564 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cux1P53564 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cux1P53564 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cux1P53564 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cux1P53564 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Cux1P53564 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Cux1P53564 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cux1P53564 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cux1P53564 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cux1P53564 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cux1P53564 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Cux1P53564 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cux1P53564 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cux1P53564 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cux1P53564 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cux1P53564 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Cux1P53564 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Cux1P53564 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cux1P53564 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cux1P53564 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cux1P53564 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cux1P53564 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cux1P53564 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cux1P53564 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Cux1P53564 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cux1P53564 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cux1P53564 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cux1P53564 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cux1P53564 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cux1P53564 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cux1P53564 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cux1P53564 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Cux1P53564 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cux1P53564 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cux1P53564 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cux1P53564 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cux1P53564 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cux1P53564 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cux1P53564 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cux1P53564 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cux1P53564 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cux1P53564 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cux1P53564 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cux1P53564 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cux1P53564 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cux1P53564 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cux1P53564 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cux1P53564 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cux1P53564 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cux1P53564 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Cux1P53564 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cux1P53564 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cux1P53564 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cux1P53564 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms