Protein–RNA interactions for Protein: P53395

Dbt, Lipoamide acyltransferase component of branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbtP53395 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DbtP53395 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DbtP53395 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DbtP53395 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DbtP53395 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DbtP53395 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DbtP53395 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DbtP53395 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DbtP53395 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DbtP53395 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DbtP53395 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DbtP53395 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DbtP53395 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DbtP53395 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DbtP53395 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DbtP53395 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DbtP53395 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DbtP53395 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DbtP53395 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DbtP53395 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DbtP53395 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DbtP53395 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DbtP53395 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DbtP53395 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DbtP53395 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DbtP53395 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DbtP53395 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DbtP53395 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DbtP53395 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DbtP53395 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DbtP53395 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DbtP53395 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DbtP53395 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DbtP53395 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DbtP53395 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DbtP53395 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DbtP53395 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DbtP53395 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DbtP53395 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DbtP53395 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DbtP53395 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DbtP53395 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DbtP53395 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DbtP53395 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DbtP53395 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DbtP53395 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DbtP53395 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DbtP53395 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DbtP53395 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DbtP53395 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DbtP53395 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DbtP53395 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DbtP53395 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DbtP53395 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DbtP53395 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DbtP53395 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DbtP53395 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DbtP53395 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DbtP53395 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DbtP53395 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DbtP53395 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DbtP53395 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DbtP53395 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DbtP53395 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DbtP53395 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DbtP53395 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DbtP53395 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DbtP53395 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DbtP53395 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DbtP53395 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DbtP53395 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DbtP53395 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DbtP53395 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DbtP53395 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DbtP53395 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DbtP53395 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DbtP53395 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DbtP53395 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DbtP53395 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DbtP53395 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DbtP53395 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DbtP53395 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DbtP53395 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DbtP53395 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DbtP53395 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DbtP53395 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DbtP53395 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DbtP53395 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DbtP53395 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DbtP53395 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DbtP53395 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DbtP53395 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DbtP53395 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DbtP53395 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DbtP53395 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DbtP53395 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DbtP53395 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DbtP53395 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DbtP53395 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DbtP53395 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms