Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Upp1P52624 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Upp1P52624 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Upp1P52624 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Upp1P52624 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Upp1P52624 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Upp1P52624 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Upp1P52624 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Upp1P52624 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Upp1P52624 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms