Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Klf1P46099 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Klf1P46099 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Klf1P46099 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Klf1P46099 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Klf1P46099 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Klf1P46099 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Klf1P46099 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Klf1P46099 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Klf1P46099 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Klf1P46099 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Klf1P46099 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Klf1P46099 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Klf1P46099 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Klf1P46099 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Klf1P46099 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Klf1P46099 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Klf1P46099 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Klf1P46099 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Klf1P46099 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Klf1P46099 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Klf1P46099 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Klf1P46099 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Klf1P46099 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Klf1P46099 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Klf1P46099 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Klf1P46099 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Klf1P46099 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Klf1P46099 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Klf1P46099 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Klf1P46099 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Klf1P46099 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Klf1P46099 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Klf1P46099 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Klf1P46099 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Klf1P46099 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Klf1P46099 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Klf1P46099 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Klf1P46099 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Klf1P46099 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Klf1P46099 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Klf1P46099 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Klf1P46099 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Klf1P46099 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Klf1P46099 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Klf1P46099 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Klf1P46099 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 690.7 ms