Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tlx1P43345 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tlx1P43345 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms