Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ThpoP40226 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ThpoP40226 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ThpoP40226 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ThpoP40226 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ThpoP40226 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ThpoP40226 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ThpoP40226 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ThpoP40226 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ThpoP40226 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ThpoP40226 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ThpoP40226 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms