Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PpargP37238 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PpargP37238 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PpargP37238 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PpargP37238 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PpargP37238 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PpargP37238 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PpargP37238 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PpargP37238 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PpargP37238 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PpargP37238 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PpargP37238 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PpargP37238 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PpargP37238 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PpargP37238 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PpargP37238 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PpargP37238 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PpargP37238 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PpargP37238 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PpargP37238 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PpargP37238 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PpargP37238 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PpargP37238 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PpargP37238 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PpargP37238 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PpargP37238 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PpargP37238 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PpargP37238 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PpargP37238 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PpargP37238 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PpargP37238 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PpargP37238 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PpargP37238 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PpargP37238 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PpargP37238 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PpargP37238 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PpargP37238 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PpargP37238 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PpargP37238 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PpargP37238 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PpargP37238 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PpargP37238 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PpargP37238 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PpargP37238 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PpargP37238 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PpargP37238 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PpargP37238 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PpargP37238 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PpargP37238 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PpargP37238 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PpargP37238 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PpargP37238 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PpargP37238 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PpargP37238 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PpargP37238 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PpargP37238 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PpargP37238 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PpargP37238 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PpargP37238 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PpargP37238 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PpargP37238 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PpargP37238 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PpargP37238 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PpargP37238 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PpargP37238 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PpargP37238 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PpargP37238 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PpargP37238 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PpargP37238 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PpargP37238 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PpargP37238 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PpargP37238 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PpargP37238 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PpargP37238 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PpargP37238 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PpargP37238 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PpargP37238 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PpargP37238 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PpargP37238 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PpargP37238 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PpargP37238 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PpargP37238 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PpargP37238 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PpargP37238 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PpargP37238 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PpargP37238 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PpargP37238 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PpargP37238 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PpargP37238 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PpargP37238 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PpargP37238 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PpargP37238 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PpargP37238 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PpargP37238 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PpargP37238 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PpargP37238 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PpargP37238 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PpargP37238 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PpargP37238 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PpargP37238 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms