Protein–RNA interactions for Protein: P35279

Rab6a, Ras-related protein Rab-6A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab6aP35279 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab6aP35279 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rab6aP35279 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab6aP35279 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab6aP35279 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab6aP35279 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab6aP35279 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab6aP35279 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab6aP35279 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab6aP35279 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab6aP35279 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab6aP35279 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab6aP35279 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms