Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ptk2P34152 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptk2P34152 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms