Protein–RNA interactions for Protein: P32883

Kras, GTPase KRas, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KrasP32883 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KrasP32883 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KrasP32883 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KrasP32883 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KrasP32883 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KrasP32883 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KrasP32883 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KrasP32883 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KrasP32883 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KrasP32883 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KrasP32883 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KrasP32883 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KrasP32883 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KrasP32883 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KrasP32883 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KrasP32883 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KrasP32883 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KrasP32883 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KrasP32883 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KrasP32883 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KrasP32883 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KrasP32883 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KrasP32883 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KrasP32883 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KrasP32883 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KrasP32883 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KrasP32883 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KrasP32883 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KrasP32883 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KrasP32883 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KrasP32883 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KrasP32883 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KrasP32883 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KrasP32883 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KrasP32883 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KrasP32883 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KrasP32883 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KrasP32883 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KrasP32883 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KrasP32883 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KrasP32883 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KrasP32883 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KrasP32883 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KrasP32883 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KrasP32883 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KrasP32883 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KrasP32883 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KrasP32883 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KrasP32883 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KrasP32883 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KrasP32883 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KrasP32883 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KrasP32883 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KrasP32883 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KrasP32883 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KrasP32883 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KrasP32883 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KrasP32883 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KrasP32883 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KrasP32883 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KrasP32883 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KrasP32883 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
KrasP32883 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KrasP32883 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KrasP32883 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KrasP32883 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KrasP32883 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KrasP32883 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KrasP32883 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KrasP32883 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KrasP32883 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KrasP32883 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KrasP32883 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KrasP32883 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KrasP32883 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KrasP32883 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KrasP32883 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KrasP32883 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KrasP32883 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KrasP32883 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KrasP32883 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KrasP32883 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KrasP32883 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KrasP32883 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KrasP32883 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KrasP32883 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KrasP32883 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KrasP32883 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KrasP32883 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KrasP32883 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KrasP32883 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KrasP32883 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KrasP32883 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KrasP32883 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KrasP32883 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KrasP32883 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KrasP32883 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KrasP32883 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KrasP32883 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KrasP32883 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms